1-ая камера септика, занимает половину всего объема септика. В ней скапливается наибольшая часть твердых отходов. Одна часть оседает, часть из них образует корку, толщиной около 10 см. Между первой и второй камерами установлен гидрозатвор, который не позволяет отходам попадать в другие камеры и засорять отверстия емкости. Жидкая часть сточных вод и часть отходов переходят во 2-ую камеру.
2-ая камера септика, занимает 3/10 от всего объема. Она необходима для вторичной очистки сточных вод. Здесь остаются более легкие частицы. Из-за отсутствия кислорода здесь погибают бактерии, живущие в первой секции.
3-я камера септика, занимает 1/5 от всего объема. В ней происходит окончательное очищение стоков.